Game ini bercerita tentang peperangan besar yang dimulai oleh Dark God Cadies. Peperangan ini telah mengubah dunia menjadi tempat yang sangat mengerikan. Untuk melawan kekuatan pasukan Dark God, Life Goddess Ileia, akhirnya menciptakan sebuah pasukan khusus pelindung legendaris yang tak terkalahkan, yaitu ARMS.
Setelah melalui peperangan yang panjang pasukan ARMS akhirnya berhasil menyegel Dark God disuatu tempat yang jauh dan tidak diketahui oleh siapapun. Namun sayang pasukan ARMS juga ikut terjebak di tempat tersebut. Pada akhirnya Dewi Ileia memindahkan semua kekuatan ARMS yang tersisa dalam Hope Seed. Dan Dewi Ileiapun terjatuh dalam tidur yang berkepanjangan.
Ribuan Tahun telah berlalu sejak peperangan itu berakhir. Dunia manusia terbagi menjadi 2 kubu yaitu Titan, bangsa yang mengutamakan pengembangan dalam hal teknologi, dan Gaia, bangsa yang dilindungi oleh kekuatan alam.
Manusia hampir melupakan bayangan kegelapan yang telah menjatuhkan dunia dalam ketakutan dan penderitaan. Hingga suatu saat, sebuah tim penjelajah menemukan sebuah reruntuhan kuno. Segel terlarang secara tak sengaja telah terurai, alam yang hidup berdampingan dengan manusia berubah menjadi monster yang ganas dan kejam. Kejadian-kejadian aneh muncul di seluruh sudut dunia. Dan belum ada yang menyadari, inilah tanda-tanda kebangkitan Dark God.
Dark God mulai bangkit dan memulai kembali invasinya, MAMPUKAH kalian melawannya ?? BUKTIKAN kekuatan kalian dalam game ini !!!